Durch Kriegshandlungen brannte die Kirche am 4. Mai 1800 ab. Die neue Kirche wurde am 18. August 1805 mit einem feierlichen Gottesdienst wieder eingeweiht.
Zu den Gottesdiensten an Sonn- und Feiertagen gingen die Gläubigen nach Löffingen. Am 6. Oktober 1831 wurde durch Beschluss des Großherzogs der Gottesdienst an Sonn- und Feiertagen eingeführt. Seit 1862 ist die Kirchengemeinde St. Leodegar in Rötenbach eine eigenständige Pfarrei.
1969-1971 erfolgte der Umbau der alten Kirche. Die figürliche Ausstattung der Kirche ist sehr wertvoll, denn sie stammt von dem weltweit bekannten Holzbildhauer Josef Rifesser aus St. Ulirch im Grödnertal/Südtirol.
Im Jahre 2006 fand eine erneute Innenrenovation statt, bei der ein Mittelgang geschaffen und die Beleuchtung erneuert wurde.